El Instituto se erige en las Sagradas Escrituras y como declaración de fe adopta las Convicciones Compartidas de los Anabautistas aprobadas por el Concilio General del Congreso Mundial Menonita, el 15 de marzo de 2006.

El Instituto tiene por fines:

1. Anunciar a Jesucristo, el Reino de Dios y su evangelio, fundamentado en la paz, la reconciliación, y la vida en comunidad como medio para la transformación de las personas, las comunidades y la sociedad en su conjunto; y

2. Servir a las personas, las iglesias y la sociedad como una comunidad anabautista-menonita de enseñanza-aprendizaje, educando a los seguidores de Jesucristo para que sean siervos de la misión reconciliadora de Dios en el mundo.

Son objetivos del Instituto:
1. Instruir, capacitar, educar y desarrollar hombres y mujeres con competencias espirituales, bíblicas, teológicas y ministeriales fundamentados en las Sagradas Escrituras y en los principios anabautistas-menonitas, a través programas de
educación cristiana y teológica, estudios y ministerios de paz y reconciliación y cuidado de la creación de Dios;

2. Realizar estudios, investigaciones, sistematizaciones, materiales educativos y divulgativos; y difundir, editar y publicarlos por todos los medios permitidos;

3. Ejecutar actividades de vinculación con las iglesias y la sociedad mediante el servicio comunitario, prestación de servicios especializados, consultorías, educación continua, capacitaciones y la difusión y promoción de los saberes
cristianos y anabautistas-menonitas;

4. Establecer alianzas estratégicas, convenios y acuerdos de cooperación con organizaciones afines, nacionales y extranjeras, para el logro de los fines y objetivos del Instituto;

5. Promover el intercambio de experiencias y saberes espirituales-teológicos, estudiantes y maestros con instituciones nacionales y extranjeras;

6. Fomentar la creación de instituciones de educación superior anabautista-menonita, previa aprobación de la Cartera de Estado competente;

7. Canalizar financiamiento, a manera de becas de estudios, para líderes y personas de escasos recursos económicos, de rendimiento sobresaliente y comprometidos con sus iglesias y comunidades de origen;

8. Adquirir, construir y adecuar cualquier tipo de bien, tanto mueble como inmueble, que se requiera para el cumplimiento de los fines y objetivos del Instituto; y,

9. Realizar todo tipo actividad, proyecto y programa compatible con la naturaleza del Instituto empleando todos los medios éticos y legales, y financieros, administrativos y técnicos para alcanzar sus fines y objetivos establecidos.